б. Покажите, что на шаге 3 расстояния от
до
, для
, могут быть вычислены с помощью формулы
.
Таблица 5.11. Расстояния между таксонами для задачи 5.3.2
.83 .28 .41
.72 .97
.48
5.3.2. Рассмотрим данные о расстояниях, приведенные в таблице 5.11. Используйте алгоритм присоединения соседей для построения дерева следующим образом:
а. Вычислите
,
,
и
, а затем заполните таблицу значений
для таксонов
,
,
и
. Для начала посчитаем
и
, получим
.
б. Если правильно справились с частью (а), то должно получиться несколько пар, имеющих одинаковое наименьшее значение
. Одним из таких наименьших значений является
, поэтому попробуем сначала присоединиться к
и
.
Для новой вершины
, с соединяются
и
, вычислите
и
по формулам из части (a) предыдущей задачи.
в. Вычислите
и
по формулам из части (б) предыдущей задачи.
Поместите свои ответы в новую версию таблицы расстояний 5.12.
г. Поскольку осталось только 3 таксона, используйте 3-точечные формулы, чтобы поместить
,
и
в дерево.
д. Нарисуйте последнее дерево, присоединив
и
к
с расстояниями, найденными в части (б).
Таблица 5.12. Групповые расстояния для задачи 5.3.2
? ?
.72
Таблица 5.13. Расстояния таксонов для задачи 5.3.3