Решив принять монарший титул, Бодуэн сталл действовать так же, как и его отец, признавший себя вассалом «Святого престола». В 1100 году Бодуэн получил титул владетельного князя от папского легата архиепископа Даимберта Пизанского, прибывшего летом 1099 года в Сирию с флотом в 100 кораблей.
Князь Бодуэн Тарантский стал планомерно расширять свои владения, в основном за счёт византийцев. Заключив союз с папским легатом епископом Даимбертом Пизанским, он обрушился на византийскую Латакию.
Его агрессии помешали другие вожди крестоносцев. Возвращаясь из Иерусалима, граф Тулузский со своими рыцарями разбили лагерь близ Латакии в Джабале. Под угрозой военного конфликта с крестоносцами Антиохийский князь вынужден был снять осаду.
Потерпев неудачу в Латакии, Бодуэн решил взять реванш в византийском Мараше.
В июле 1101 года князь Бодуэн и Рожер Салернский напали на Мараш. Но им пришлось снять осаду, поскольку рыцарей позвал на помощь армянский князь Гавриил, правитель Милитены. С 300 рыцарей Бодуэн поспешил на помощь, но попал в засаду и был пленён эмиром Каппадокии Гази ибн Данишмендом. Князя отправили в Неокесарию (Никсар) на Чёрном море.
Антиохийские бароны Робер де Сурдеваль, Рено де Мазуар, Робер Флорентийский, коннетабли Ричард и Адам, дука Антиохии Рауль Арский избрали регентом Танкреда. Граф Эдессы Бодуэн Булонский поставил во главе гарнизона Антиохии Бодуэна Ретельского.
Но в 1101 году в государственном управлении франкских государств на Востоке произошли коренные изменения. Умер первый Иерусалимский монарх Годфруа Булонский и бароны предложили престол его брату графу Эдессы. Бодуэн Булонский отправившись в Иерусалим, передав Эдессу своему родственнику Бодуэну де Ретелю. Антиохия оказалась под полным контролем Танкреда.
Князь Бодуэн Тарантский заложил основу для образования независимого государства в Сирии – княжества Антиохии. В действительности князь Бодуэн действительно много сделал для завоевания Антиохии. Гораздо больше, чем все остальные крестоносцы. Ещё до начала и во время осады города Бодуэн разгромил мусульманские войска, прибывавшие на помощь к осаждённым из Мосула, Дамаска и Алеппо. Именно с ним связались антиохийцы, желая передать город рыцарям.
Однако окончательному становлению княжества помешало пленение Бодуэна. Он получил свободу лишь через 3 года, весной 1103 года. Его племянник Танкред, управлявший владениями дяди, не спешил с выкупом. Решающую роль в сборе денег, а это 100 тысяч золотых империалов (тагеханов), сыграли армянский князь Василий Гох и латинский Антиохийский патриарх Бертран. Танкред лишь в добавление к выкупу освободил несколько знатных мусульманских пленников. Собранные деньги отвозил эмиру князь Василий Гох.
Бодуэн в Европе
Получив свободу, Бодуэн вновь вступил в борьбу с мусульманами. В 1104 году он значительно расширил свою вотчину, захватив Абластаин (Эльбистан) и всю область Джихана, то есть земли от истоков реки Пир (Джихан) до впадения в Средиземное море. Но поражение 7 мая 1104 года в битве с мусульманами у Харрана, когда в плен попал союзник князя граф Бодуэн II де Ретель Эдесский, заставило Бодуэна искать помощь в Европе. Поскольку последствия после поражения у Харрана очень негативно отразились на положении Антиохийского княжества.
Это было первое поражение крестоносцев на Востоке, сразу изменившее соотношение сил в регионе в пользу мусульман. От Антиохийского княжества отпал Артах, население города признало власть эмира. Антиохийские гарнизоны оставили пограничные замки Кафартаб, аль-Маарру, эль Бару. А эмир Ридван Алеппский совершил опустошительный набег в пределы княжества, заняв несколько крепостей.
Ослаблением Антиохийского княжества предпочла воспользоваться Византия. Императорские войска оккупировали Равнинную Киликию и Лаодикею.
Поздней осенью Бодуэн Тарантский на 13 кораблях с архиепископом Пизы Даимбертом отплыл из Сирии в Европу за помощью. Регентом он назначил племянника Танкреда.
В Италии и Франции князя Антиохии приветствовали как героя. Его появление собирало толпы возбуждённых людей. Именно христианская доблесть князя Бодуэна способствовала его браку с Французской принцессой Констанцией.
На встречах с монархами и знатными вельможами Бодуэн Антиохийский рассказывал о предательстве христианского дела Византийским императором Алексеем I Комниным и просил помощи для борьбы с коварными византийцами.
В 1106 году в день венчания в соборе Пресвятой Девы Марии в Шартре, одобрения Римского папы Пасхалия II, Антиохийский князь призвал французских рыцарей отправиться в новый крестовый поход против византийцев.
В 1107 году князь Бодуэн начал военную компанию против Византии на Балканах.
Однако император Алексей I, благодаря турецким наёмникам и венецианской помощи смог отразить натиск нормандцев. Бодуэн сдался. В сентябре 1108 года был подписан Девольский мирный договор, в военном лагере возле реки Девон в современной Албании.
Согласно договору князь Бодуэн Антиохийский признавал себя вассалом Византийского императора. Фактически византийцы напомнили Бодуэну о том, что он присягал империи в самом начале крестового похода, когда находился в Константинополе. Император Алексей I признавался сюзереном над своими землями основанными крестоносцами. Его права трактовались таким образом, что правители франкских государств якобы управляют своими землями лишь по воле императора.
Кроме того, Бодуэн обещал сражаться на стороне императора. Подчинить империи своих вассалов. Предать под власть Византии, отбытые у мусульман ранее принадлежавшие империи земли.
Антиохийское княжество Бодуэн получал в дар «до конца жизни» от Византийского императора Алексея I, и после смерти Антиохия должна была вернуться под власть империи. От Антиохии отторгались города в горной Киликии – Тарс, Адана, Мамистра и другие. В качестве компенсации император Алексей I передавал князю Бодуэну территории, которые ещё нужно было отвоевать у мусульман и претендовать на субсидии из императорской казны.