После подписания договоров о взаимопомощи Москве следовало реализовать полученное право на ввод войск в Прибалтику. 30 сентября нарком обороны издал директиву № 071 об образовании военной комиссии под председательством командующего войсками ЛВО командарма 2-го ранга К.А. Мерецкова, целью которой было «совместно с представителями Правительства Эстонии установить пункты размещения и обсудить вопросы устройства частей Красной Армии, подлежащих размещению на территории Эстонской Республики, примерно в следующих районах:
а) Стрелковые войска – управление стрелкового корпуса, управление стрелковой дивизии, один стрелковый полк, гаубичный артполк, танковый батальон и спец[иальные] части дивизии в районе Балтийский порт [Палдиски] – Таллин; один стрелковый полк с одним артиллерийским дивизионом артполка дивизии на островах Эзель [Сааремаа], Даго [Хийумаа], имея на острове Даго один стрелковый батальон; один стрелковый полк и артиллерийский полк без одного дивизиона в районах Хапсола [Хаапсалу] – Таллин.
б) Конница – отдельная кавбригада в составе двух кав[алерийских] полков, танкового полка и артдивизиона в районе Вильянди и Валк;
в) Мотомехвойска – танковая бригада в составе четырех танковых батальонов и стрелково-пулеметного батальона в районе Тюри и северо-западнее от этого пункта;
г) Авиация – один истребительный полк на островах Эзель, Даго, один истребительный полк в районе Вильянди, Валк, один полк СБ в районе Пайде.
Комиссия обязана осмотреть выделяемые Эстонским Правительством казармы и здания для размещения войск, отвести строго необходимые земельные участки под аэродромы и танкодромы и выяснить, какое строительство необходимо провести, составить план этого строительства». Комиссии следовало вылететь из Ленинграда 1 октября и завершить работу не позднее 8 октября[361 - РГВА. Ф. 37977. Оп. 1. Д. 391. Л. 77–79; Полпреды сообщают… С. 72; Венков И.Н. «Допустить размещение войск…» // Военно-исторический журнал. 1990. № 4. С. 35–36.].
Одновременно начальник Генштаба РККА направил Военному совету ЛВО директиву № 4/2/49287/сс с конкретными указаниями по подготовке войск для ввода на территорию Эстонии:
«В дополнение директивы № 071 от 30.9.39 г. организационный состав войск устанавливается следующий:
1. 65[-е] Управление корпуса, численностью 56 человек. Управление формируется распоряжением Военного Совета ЛВО по штату № 4/1.
2. 123[-й] батальон связи по штату № 04/801, с исключением:
а) двух телеграфно-кабельных рот на конной тяге – 160 человек;
б) двух взводов на конной тяге из телеграфно-шестовой роты – 96 человек;
в) ветфельдшерского пункта – 4 чел.
Общая численность батальона, после исключения, определяется в 516 чел.
Батальон выделяется из батальона связи 19[-го] с[трелкового] к[орпуса]. Последний восстановить распоряжением Военного Совета ЛВО за счет войск связи округа.
3. 11[-й] отд[ельный] зенитный арт[иллерийский] дивизион 33[-го] с[трелкового] к[орпуса] реорганизовать по штату № 50/838 с добавлением 8 тракторов ЧТЗ, 15 автомашин ЗИС-5 и с доведением штатных должностей, по усмотрению Военного Совета ЛВО, до общей численности 300 человек.
4. 16[-ю] стрелковую дивизию реорганизовать по прилагаемому штату, имея общей численностью в 13 790 человек.
5. 18[-ю] легко-танковую бригаду БТ-7 реорганизовать по прилагаемому штату, имея общей численностью в 3 400 человек.
6. 25[-ю] кавалерийскую дивизию реорганизовать по прилагаемым штатам в две отдельные кав[алерийские] бригады:
а) 5[-я] отд[ельная] кав[алерийская] бригада с 50-м танковым полком;
б) 7[-я] отд[ельная] кав[алерийская] бригада без танкового полка.
Последняя остается в пункте дислокации 25[-й] кав[алерийской] дивизии.
7. Распоряжением Военного Совета ЛВО из состава военно-воздушных сил округа выделить:
а) управление авиабригады по штату № 15/965 с добавлением штата № 15/829 общей численностью 52 чел.;
б) два истребительных полка 4-х эскадрилий каждый, по штату № 15/828 литер Д и 15/806 литер Д, общей численностью по 285 человек полк;
в) два полка скоростных бомбардировщиков (СБ) 5-ти эскадрилий каждый, по штату № 15/828 лит[ер] Б и 15/807 лит[ер] В, общей численностью по 500 человек полк;
г) две авиабазы для обслуживания истребительных полков, по штату № 15/819 литер В с усилением стрелковой роты до 112 человек, общей численностью каждая 310 человек;
д) две авиабазы для обслуживания полков СБ, по штату № 15/819 лит[ер] Б, общей численностью каждая 509 человек.
8. 417[-й] и 418[-й] отд[ельные] авто-батальоны реорганизовать, согласно прилагаемого перечня изменений к штату № 032/703 лит[ер] Б, имея каждый батальон численностью в 400 человек.
9. Весь личный состав должен быть тщательно отобран и политически проверен. В числе мобилизованных не должно быть старше рождения 1909 г.
10. Все выделяемые части обеспечить только первосрочным обмундированием, снаряжением и амуницией.
Вся материальная часть должна быть в полной исправности и просмотрена специальными комиссиями Военного Совета округа. Все негодное должно быть не медля заменено на первосрочное.
11. Весь личный состав обеспечить постельной принадлежностью.
12. Подробный боевой состав выделяемых частей донести в Генеральный Штаб особым нарочным 4-го октября 1939 года»[362 - РГВА. Ф. 37837. Оп. 22. Д. 60. Л. 301–303.].
Получив эти приказы, Военный совет ЛВО в тот же день принял решение «наметить следующие мероприятия:
1. Пересмотреть: а) весь начальствующий и рядовой состав выделяемых соединений, частей и управлений с целью отбора личн[ого] состава по политико-моральным качествам, по семейно-имущественному положению и возрасту;
б) все обмундирование и амуницию, санитарно-ветеринарное имущество;
в) все боевое вооружение, инженерное, химическое, автобронетанковое имущество;
г) весь конский состав, обоз, автомобильный и тракторный парк.
2. Замену и пополнение личного состава, имущества, транспорта и конского состава командируемых частей произвести по следующему плану:
Смешанную авиабригаду сформировать – два истребительных полка за счет 25[-го], 38[-го] и 49[-го] а[виа]п[олков] и один полк СБ – на базе 35[-го] и 44[-го] полков СБ.
Начальствующий и рядовой состав 16 сд – за счет замены и подбора из 11 сд; отдельную кавбригаду сформировать на базе 97[-го] и 98[-го] кавполков, танкового полка, двух батарей артдивизиона, специальных эскадронов и управления 25 кд; 18[-ю] танк[овую] бр[игаду] за счет частей 10 ТК». Так же следовало создать комиссии, которые должны были 1–3 октября проверить подготовку отправляемых в Эстонию войск[363 - Там же. Ф. 25888. Оп. 1. Д. 367. Л. 5–6, 7–9, 10–14.].
В связи с подписанием советско-эстонского договора о взаимопомощи соответствующие решения были приняты и по линии военно-морского командования. Так, уже в 8.30 30 сентября начальник Главного морского штаба флагман флота 2-го ранга Л.М. Галлер направил Военному совету КБФ телеграмму № 1/244: «Нарком приказал передать находящимся в море подлодкам: Эстонией заключен договор. Поставленные Вам задачи отменяются. В соответствии с этим оставить в устье Финского залива две подводные лодки подальше от берегов с задачей только разведки, остальные подлодки вернуть в базу. Места оставленных подлодок [в] море установить Вашим распоряжением»[364 - Там же. Ф. 37977. Оп. 1. Д. 246. Л. 22.]. Соответственно подводные лодки «Щ-323», «Щ-320», «Щ-319», «Щ-317», «Щ-324» и «С-2» были отозваны в Кронштадт, а «С-1» и «С-3» остались на позиции в устье Финского залива для ведения разведки[365 - Там же. Д. 390. Л. 28.]. Затем в 13.46 30 сентября начальник Главного морского штаба флагман флота 2-го ранга Л.М. Галлер направил Военным советам КБФ и ЛВО телеграмму № 1/245: «Нарком приказал готовность флота оставить в силе, обратить особое внимание на охрану линкоров. Десантную операцию полностью готовить. Если не потребуется действительная операция, будет проведено учение с тем, чтобы после роспуска организации иметь возможность при необходимости собрать ее вновь»[366 - Там же. Д. 246. Л. 23; Ф. 25888. Оп. 11. Д. 14. Л. 10.]. С 22 часов 3 октября корабли Отряда особого назначения КБФ начали возвращаться в Кронштадт и 4 октября уже находились в местах постоянной дислокации[367 - Там же. Ф. 37977. Оп. 1. Д. 309. Л. 39–41.].
Тем временем 1 октября нарком Военно-морского флота флагман флота 2-го ранга Н.Г. Кузнецов направил в ЦК ВКП(б) и СНК СССР докладную записку № 3011/сс: «При сем представляю на утверждение директиву, данную мной Председателю Комиссии в Эстонию от НКВМФ Заместителю Народного Комиссара Военно-Морского Флота Союза ССР флагману флота 2-го ранга тов. Исакову И.С. Директива согласована с Народным Комиссаром Обороны Союза ССР Маршалом Советского Союза тов. Ворошиловым К.Е.»[368 - РГАСПИ. Ф. 17. Оп. 166. Д. 614. Л. 225–226.]. Соответственно 2 октября Политбюро ЦК ВКП(б) приняло решение утвердить директиву наркома Военно-морского флота № 3010/сс от 1 октября о переговорах с Эстонией:
«Для разрешения всех вопросов, связанных с определением точных мест базирования Рабоче-Крестьянского Военно-Морского Флота и определения границ территорий их, в соответствии с договором между СССР и Эстонской Республикой, назначается комиссия под Вашим председательством, при членах:
Командующий Краснознаменным Балтийским флотом флагман 2[-го] ранга тов. Трибуц В.Ф.
Зам[еститель] Начальника Главного Морского Штаба капитан 1[-го] ранга тов. Алафузов В.А.
Командующий Военно-Воздушными Силами КБФ комбриг тов. Кузнецов А.А.
Зам[еститель] Начальника Технического Управления НКВМФ военинженер 2[-го] ранга тов. Гулим И.С.
Вам надлежит, согласовывая свои действия с Командармом 2[-го] ранга тов. Мерецковым, совместно с представителями Эстонского правительства определить места базирования кораблей флота, места установки береговых батарей, места позиций жел[езно]дор[ожной] артиллерии, аэродромы и территории, необходимые для расквартирования и обеспечения частей РКВМФ, переводимых в Эстонию.